Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LACTB2Q53H82 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms