Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD2Q4W5G0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD2Q4W5G0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms