Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms