Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms