Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms