Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRNQ16849 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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