Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms