Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ZNF56Q15929 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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