Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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