Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms