Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF6Q15052 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF6Q15052 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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