Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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