Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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