Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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