Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNB1Q14721 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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