Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.745e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RNF8-207ENST00000494320 977 ntTSL 525.45■■□□□ 1.665e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 223.62■■□□□ 1.373e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DEK-207ENST00000515742 661 ntTSL 223.07■■□□□ 1.285e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-202ENST00000412924 998 ntTSL 522.99■■□□□ 1.273e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SEC31A-223ENST00000507816 546 ntTSL 422.28■■□□□ 1.165e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.13e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 520.73■□□□□ 0.915e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.895e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-205ENST00000579365 560 ntTSL 420.38■□□□□ 0.855e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RNF8-205ENST00000479516 1525 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.775e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-206ENST00000426031 491 ntTSL 319.85■□□□□ 0.773e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-207ENST00000491231 1719 ntTSL 519.84■□□□□ 0.775e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-217ENST00000508299 592 ntTSL 219.81■□□□□ 0.765e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.745e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 319.54■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.75e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.685e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-206ENST00000581618 613 ntTSL 419.28■□□□□ 0.685e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 518.75■□□□□ 0.595e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-204ENST00000578015 448 ntTSL 218.58■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-208ENST00000584289 1090 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-218ENST00000554772 562 ntTSL 318.49■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.37■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-208ENST00000492066 1627 ntTSL 518.37■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ANKRD11-214ENST00000568100 878 ntTSL 218.29■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-214ENST00000554331 831 ntTSL 218■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-236ENST00000556783 567 ntTSL 518■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.62■□□□□ 0.415e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.44e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.43e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BHLHE40-203ENST00000467610 1366 ntTSL 217.5■□□□□ 0.395e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.365e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 417.05■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 216.68■□□□□ 0.263e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-206ENST00000488303 604 ntTSL 516.64■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-206ENST00000553413 568 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NET1-203ENST00000449083 637 ntTSL 515.75■□□□□ 0.115e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPP4R3A-207ENST00000555029 571 ntTSL 515.48■□□□□ 0.073e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 515.13■□□□□ 0.015e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.015e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 215.06■□□□□ 05e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.92□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-212ENST00000485292 790 ntTSL 214.91□□□□□ -0.025e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-222ENST00000555063 573 ntTSL 214.89□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DROSHA-218ENST00000512302 585 ntTSL 414.81□□□□□ -0.044e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DARS-203ENST00000435076 717 ntTSL 214.79□□□□□ -0.045e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-204ENST00000424390 795 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 STX5-204ENST00000431400 723 ntTSL 214.61□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 214.54□□□□□ -0.083e-8■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 214.28□□□□□ -0.124e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 214.28□□□□□ -0.124e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPL-209ENST00000600741 624 ntTSL 214.18□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 414.05□□□□□ -0.164e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-215ENST00000554509 563 ntTSL 413.97□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-231ENST00000556579 565 ntTSL 213.97□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.244e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TTF2-205ENST00000470935 849 ntTSL 513.56□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MIER1-211ENST00000493357 473 ntTSL 213.43□□□□□ -0.263e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 213.25□□□□□ -0.295e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 513.14□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-210ENST00000553769 560 ntTSL 412.87□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-217ENST00000554605 560 ntTSL 312.87□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SSR1-205ENST00000475213 446 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-10■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.384e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 8.5
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