Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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