Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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