Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPP1R1AQ13522 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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