Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD4Q13485 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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