Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms