Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TP53BP1Q12888 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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