Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNL1Q0VF96 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms