Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms