Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms