Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms