Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms