Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms