Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms