Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms