Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms