Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms