Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO4P98177 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO4P98177 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms