Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB1P82279 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB1P82279 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB1P82279 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms