Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VBP1P61758 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms