Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABP4P57796 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms