Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms