Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ATP5EP56381 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ATP5EP56381 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms