Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFDNP55196 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms