Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA2D1P54289 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms