Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA4P51532 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA4P51532 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms