Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTDSS1P48651 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms