Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms