Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTRNP46939 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms