Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms