Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRXP46100 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRXP46100 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms