Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms