Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NR4A2P43354 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms