Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms