Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ECI1P42126 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ECI1P42126 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECI1P42126 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms